山西省腐烂茎线虫群体的形态和遗传分析

本研究对分离自山西省马铃薯、甘薯和薯蓣块茎中的腐烂茎线虫8个群体进行形态特征观察和数值测量，对形态数据进行SPSS差异显著性和PCA分析；采用通用引物对其ITS rDNA进行PCR扩增与序列测定，利用Geneious Prime 2019.2.3和DNAMAN 9.0软件计算相似距离和序列比对，Arlequin 3.5软件中的AMOVA模块分析分子变异Medical organization方差，MrBayeAY-22989配制s3.2.7构建贝叶斯系统发育树，并用PopART4.8.4软件构建TCS单倍型网络图。结果表明，腐烂茎线虫群体YH277、YH279、tg38、XF01、CZ15、TY15、tg49属于A型，寄主有甘薯、马铃薯和薯蓣；为害马铃薯群体PX04属于C型。PX04和其余7个群体在形态上存在明显差异，尾部稍尖；PCA分析PX04与其他7个群体可以明显区分开。选用薯类作物为寄主的腐烂茎线虫77条ITS序列构建TCS单倍型网络图，结果显示共享单倍型2个和独享单倍型26个。其中H1单倍型是共享率最高的，推测其可能为祖先单倍型；26个独享单倍型中马铃薯群体独享数目最多，其群体单倍型和核苷酸多样性最丰富，单倍型多样性指数Hd值为0.841，群体间核苷酸多样性指数Pi值为0.00502。AMOVA分析表明，山西省腐烂茎线虫遗传差异主要来源于种群OXPHOS抑制剂间，腐烂茎线虫A型与C型之间存在较大的遗传分化。