急性髓系白血病mRNA与非编码RNA差异表达谱及CeRNA调控网络分析

利用GEO数据库(gene expression omnibus database)通过生物信息学分析方AY-22989生产商法探讨急性髓系白血病(acute myelogenousleukemia,AML)的发病机制。检索GEO数据库中AML相关芯片数据集GSE142698、GSE142699和GSE96535。利用GEO2R分析得到差异mRNAs、miRNAs以及差异lncRNAs。利用在线生物信息学分析工具DAVID对差异mRNAs进行GO富集分析和KEGG通路分析。利用miRWalk数据库预测AML相关miRNAs的靶向mRNAs，利用Spongescan数据库预测AML相关miRNAs的靶向lncRNAs，构建lncRNA-miRNA-mRNA竞争性内源RNPR-171说明书A (competing endogenous RNA,ceRNA)调控网络。共筛选出29个显著差异mRNAs、70个显著差异miRbiological calibrationsNAs和20 005个显著差异lncRNAs。GO富集分析和KEGG通路分析显示，差异表达基因主要涉及蛋白磷酸化、细胞分裂、细胞增殖的负调控、基因表达的正向调节、周期蛋白依赖的丝氨酸/苏氨酸激酶活性的调节等生物过程以及细胞周期、细胞衰老、癌症通路、PI3KAkt通路等信号通路。将miRWalk数据库预测的靶向mRNAs与差异mRNAs取交集，Spongescan数据库预测的靶向lncRNAs与差异lncRNAs取交集，分别确定了25个mRNAs、6个lncRNAs参与AML相关ceRNA调控网络的构建。结果表明，lncRNAs可能作为关键的ceRNA，通过调控miRNA和相关靶基因参与AML的发生与发展，研究结果为AML诊断和治疗的分子生物学研究提供了新的依据。