猪细小病毒BJ2株的分离鉴定及全基因组序列分析

为了解国内猪细小病毒(PPV)的流行、毒株变异情况,采用PPV特异性PCR方法检测2020—2021年从江苏、河南和北京3个省市采集的组织样品,将PPV阳性病料接种猪睾丸细胞(ST)进行Evolutionary biology病毒分离,利用间接免疫荧光方法(IFA)、实时荧光定量PCR(qPCR)和电镜观察对分离株进行鉴定,并测定分离株全基因组核苷酸序列,之后应用MEGA 6.0和MegAlign软件对分离株进行遗传变异分析。结果表明,成功分离到1株PPV,命名为BJ2株;全基因组核苷酸一致性分析结果显示,BJ2株与皮炎型强毒株Kresse株、Challenge株GNE-140核苷酸一致性为99.3%,与实验室2019年分离株HeN1202株核苷酸一致性为95.9%;VP2基因核苷酸一致性和遗传进化分Ipatasertib NMR析结果显示,BJ2株与德国27a株处于同一进化分支,其核苷酸一致性为99.3%,HeN1202株与弱毒株NADL-2株亲缘关系较近;BJ2株与德国27a株相比,VP2蛋白氨基酸序列存在2个位点差异。综上,PPV BJ2株与德国27a株亲缘关系较近。