【目的】通过对青钱柳全基因组序列的分析，开发基因组SSR分子标记；初步尝试KD025半抑制浓度构建19个青钱柳优良药用无性系的DNA分子身份证，为后续种质资源评价、遗传多样性和种质鉴定提供技术支撑。【方法】利用MISA（Microsatellite Identification Tool）软件对青钱柳全基因组进行SSR位点搜寻、筛选、识别及富集分析，采用Primer 3.0进行SSR引物设计；用重复性和稳定性高的SSR标记构建青钱柳无性系的识别系统。【结果】（1）从全基因组中共检测出89741个SSR位点，SSR位Vorinostat点的发生频率为62.07%。（2）基因组SSR位点中单核苷酸重复单元比例最高，占总SSR位点的62.67%；六核苷酸重复单元比例最低，占0.15%；SSR位点的重复基序大多以（A/T）n为主。（3）单核苷酸和二核苷酸重复类型的SSskin infectionR位点基序重复次数集中在6～16次；随重复次数增加，各SSR位点重复类型出现的频率均呈下降趋势。（4）基因组SSR序列长度介于10～476 bp，不同类型重复单元的SSR序列长度存在变异性；随着重复次数的增加，SSR序列出现的频率整体呈下降趋势。（5）利用Primer 3.0成功设计出78285对SSR引物；合成的377对中有75对引物可扩增出多态性条带；用5对单碱基重复的多态性SSR引物分析19个药用无性系，构建出无性系的二维码DNA分子身份证。【结论】青钱柳基因组SSR位点出现频率高，位点种类丰富，可为种质资源评价及指纹图谱的构建提供丰富的候选分子标记。