河南省山药病毒病病原鉴定及主要病毒的序列分析

为开展河南省山药病毒种类及遗传变异的系统性研究，通过高通量测序（high-throughput sequencing）和RT-PCR检测疑似病毒病的山药样品188份，结果表明从山药样品中检测出5种病毒：日本山药花叶病毒(Japanese yam mosaic virus, JYMV)、油菜花叶病毒（youcai mosaiselleck抑制剂c virus,YoMV）、山药潜隐病毒（yam latent virus, YLV）、蚕豆萎蔫病毒-2(broad bean wilt virus 2, BBWV-2)和淮山药黄斑花叶病Canagliflozin核磁毒（yam yellow spot mosaicvirus,YYSMV）。JYMV、YoMV、YYSMV、BBWV-2和YLV的检出率分别为94.15%、87.23%、68.09%、42.02%和29.79%，其中98.94%的山药样品都存在复合侵染现象。本研究统计188份样品中共有20种复合侵染类型，其中JYMV+YYSMV+YoMV是主要复合侵染类型，检出率是26.60%。序列分析结果表明，YoMV和JYMV较保守，其次是YYSMV,secondary infectionYLV和BBWV2变异较大，遗传进化树分析结果表明本研究获得的分离物与同一地区的分离物亲缘关系较近。同时HTS分析结果表明在山药上检测到其他未明确分类地位的病毒种类，因此后续还需全面系统地对河南省山药病毒的种类开展研究。