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本研究对分离自山西省马铃薯、甘薯和薯蓣块茎中的腐烂茎线虫8个群体进行形态特征观察和数值测量，对形态数据进行SPSS差异显著性和PCA分析；采用通用引物对其ITS rDNA进行PCR扩增与序列测定，利用Geneious Prime 2019.2.3和DNAMAN 9.0软件计算相似距离和序列比对，Arlequin 3.5软件中的AMOVA模块分析分子变异Medical organization方差，MrBayeAY-22989配制s3.2.7构建贝叶斯系统发育树，并用PopART4.8.4软件构建TCS单倍型网络图。结果表明，腐烂茎线虫群体YH277、YH279、tg38、XF01、CZ15、TY15、tg49属于A型，寄主有甘薯、马铃薯和薯蓣；为害马铃薯群体PX04属于C型。PX04和其余7个群体在形态上存在明显差异，尾部稍尖；PCA分析PX04与其他7个群体可以明显区分开。选用薯类作物为寄主的腐烂茎线虫77条ITS序列构建TCS单倍型网络图，结果显示共享单倍型2个和独享单倍型26个。其中H1单倍型是共享率最高的，推测其可能为祖先单倍型；26个独享单倍型中马铃薯群体独享数目最多，其群体单倍型和核苷酸多样性最丰富，单倍型多样性指数Hd值为0.841，群体间核苷酸多样性指数Pi值为0.00502。AMOVA分析表明，山西省腐烂茎线虫遗传差异主要来源于种群OXPHOS抑制剂间，腐烂茎线虫A型与C型之间存在较大的遗传分化。

目的构建并鉴定巨噬细胞条件性高尔基体蛋白73(golgi protein 73,GP73）基因敲除小鼠，为进一步研究GP73调控巨噬细胞功能影响肿瘤性疾病的发生发展提供动物模型。方法基于Cre/LoxP重组系统构建GP73~(fMedical diagnoseslox/+)小鼠，通过GP73 ~(flox/+)小鼠雌雄自交得到GP73~(flox/flox)小鼠。将GP73~(flox/flox)小鼠与Lyz2-Cre~+小鼠杂交，得到GP73~(flox/+)Lyz2-Cre~+小鼠，再将其与GP73~(flox/flox)小鼠杂交，最终得到基因型为GP73~(flox/flox )Lyz2-Cre~+的巨噬细胞条件性GP73基因敲除小鼠（MKO小鼠）；以GP73~(flox/flox )Lyz2-Cre~-小鼠作为对照组小鼠（GP73~(fl/fl)小鼠）。采用PCR和琼脂糖凝胶电泳鉴定小鼠flox及Cre基因型。采用实时荧光定量PCR(qPCR）及蛋白免疫印迹（Western blot）分别从mRNA水平和蛋白水平验证小鼠巨噬细胞GP73敲除效果及组织特异性。计算小鼠各组织质量与体重的比值以分析小鼠的生长发育情况，并检测小鼠血生化指标。结果通过基因鉴定、mRNA水平及蛋白水平证实巨噬细胞条件性GP73基因敲除小鼠构建成功。qPCR检测显示，与GP73~(fl/fl)小鼠相比，MKO小鼠骨髓来源巨噬细胞（bone marrow-derived macrophages,BMDMs）和腹腔原位巨噬细胞（peritoneal macrophages,PM）中GP73 mRNA水平均降低（P<0.0001);Western blot检测结果显示，GP73蛋白在MKO小鼠BMDMs和PM中的表达水平均较GP73~(fl/fl)小鼠明显降低，但在肝脏、肾脏及胸腺组织中GP73蛋白表达水平无显著差异。与GP73~(fl/fl)小鼠相比，MKO小鼠心、肝、脾、AM-2282肺、肾、棕色脂肪及白色脂肪组织重量与体重之比无差异，各组织无形态学差selleckchem异。血生化检测结果显示，MKO小鼠与GP73~(fl/fl)小鼠的各项血生化指标差异均无统计学意义（P>0.05）。结论成功构建巨噬细胞条件性GP73基因敲除小鼠模型，为深入研究GP73调控巨噬细胞功能在肿瘤性疾病中的作用和机制提供良好的动物模型。

研究藏系绵羊群体的遗传结构和遗传多样性,有助于深入了解藏系绵羊的遗传特征和群体多样性水平,制定相应的保护策略和方案,进而保护藏系绵羊的遗传资源。盘欧羊选育群体(Panou,PO)是以盘羊(英文名:Argali,AG;拉丁学名:Ovis ammon)为父本,欧拉羊(Oula,OL)为母本,经过杂交选育形成。然而,目前尚未见到有关盘欧羊选育群体全基因组遗传特征系统研究的相关报道。因此,本研究通过对盘欧羊选育群体和欧拉羊群体(每个群体各采集10只母羊的血液样本)进行全基因组重测序,并从NCBI(National Center for Biotechnology Information)数据库中下载了10只盘羊基因组重测序数据,深入研究三个绵羊群体的遗传结构和亲缘关系,挖掘盘欧羊选育群体在长期自然选择和人工选择环境中的受选择位点和基因,为后期分子标记辅助育种提供理论依据。本研究主要取得如下研究结果:1.通过对变异位点的严格质控过滤,在盘欧羊选育群体中最终确定了24,005,783个SNPs(Single nucleotide polymorphism,单核苷酸多态性)和306,560个IDolutegravir浓度n Dels(insertion-deletion,插入缺失突变),平均每个样本检测到9,455,917个SNPs。这些SNPs主要位于基因间区,平均每个样本6,119,140个;其次是内含子区,平均每个样本3,174,171个;少量分布在外显子区域、剪切位点、上游和下游基因等其他区域。SNPs功能注释结果以同义替换和非同义替换为主,非同义突变22,297个,同义突变34,756个,非同义/同义SNP的比率为0.64。盘欧羊选育群体SNPs的平均转换数为6,732,126个,颠换数为2,723,791个,转换/颠换值为2.47。平均每个样本有4,052,050个(43.42%)纯合子和5,403,867个(56.58%)杂合子,纯合/杂合SNP比为0.77。这些变异数据能为进一步研究盘欧羊选育群体的遗传特性提供基因组数据支持。2.利用主成分分析、ADMIXTURE分析和系统发生树分析,探究了三个群体的遗传结构。结果表明,按照群体遗传距离的远近,30个样本可分为三个分枝,即野生绵羊群体(盘羊)分枝,地方绵羊群体(欧拉羊)分枝和选育绵羊群体(盘欧羊)分枝。盘欧羊选育群体与欧拉羊群体分枝的亲缘关系较近,且两群体存在一定的遗传分化现象。对盘欧羊选育群体和欧multiple bioactive constituents拉羊群体的遗传多样性分析发现,核苷酸多样性值均在地方绵羊群体估计值的范围内(π=2.44-2.84)。通过比较发现,欧拉羊群体的各遗传多样性参数均高于盘欧羊选育群体。群体遗传结构分析结果显示,盘欧羊选育群体的分布比欧拉羊群体更为分散,反映了盘欧羊选育群体个体间的遗传差异相对较大,经过长期的人工选育,该群体逐渐形成了有别于欧拉羊群体的独特基因库。3.利用盘欧羊选育群体和欧拉羊群体全基因组重测序数据中的SNP数据集,分析这两个群体基因组中连续性纯合片段(Runs of homozygosity,ROH)的数量、长度和分布模式。同时,基于ROH计算了两个绵羊群体的近交系数,并对ROH高频区域的基因进行了鉴定。共检测出740个ROHs,每个样本中平均检测到37个ROHs。在两个群体中,96%以上的ROH长度在0-1 Mb范围内。其中,OAR3染色体上检测到的ROH片段最长,141.44Mb,包含94,171个SNPs,平均长度为2.15Mb;其次是OAR2染色体,长度128.76Mb,包含100,496个SNPs。总体而言,每个染色体的ROH数量随着染色体长度的减少而减少。染色体ROH百分比最高的是OAR3(8.90%)和OAR2(8.10%),而最低的是OAR21(0.82%)。欧拉羊群体的近交系数低于盘欧羊选育群体(F_(ROH_PO)=0.081,F_(ROH_OL)=0.078)。本试验共获得66个ROH Islands,ROH Island的长度范围从OAR2上的13.21kb到OAR19上的682.57kb。通过注释每个ROH Island中的基因,获得了35个共有注释基因。在染色体OAR1、OAR2、OAR6、OAR14和OAR15上发现了跨越多个基因的最强候选区域,确定了BI 10773半抑制浓度6个与生长发育、免疫应答和低氧适应相关的基因:SPTA1、GALNTL6、SPP1、ABCG2、CDH1和PDE2A。4.采用Fst(Fixation Index,遗传分化系数)和πratio(核苷酸多样性变化倍数)两种统计方法,以盘欧羊选育群体为选择群体,欧拉羊群体为背景群体,鉴定盘欧羊选育群体在人工选择育种过程中的受选择区域和基因。最终获得与低氧反应、生长发育、抗病性、毛色和繁殖性状相关的7个候选基因:HDAC9,PTK2,MITF,VAT1、TCHHL1、AOC3、IFI35。对这些基因进行功能富集分析,发现候选基因主要富集在连接酶活性、氨酰t RNA和相关化合物的形成(GO:0004812;P<0.01)、AP型覆膜接头复合体(GO:0030119;P<0.05)和经典Wnt信号通路(GO:0060070;P<0.01)等通路上。这与盘欧羊选育群体具有适应性强,生长发育速度快和抗病性强等特点相吻合。这些发现加深了对盘欧羊选育群体基因组特征的了解,并为今后盘欧羊选育群体基因型-表型关系研究提供了有价值的信息。5.利用盘欧羊选育群体和欧拉羊群体全基因组重测序数据集,进行全基因组拷贝数变异(Copy number variation,CNV)检测,在常染色体上检测到平均1,788个“缺失”和1,232个“重复”,平均“缺失”片段大小为20.91Kb,平均“重复”片段大小为19.66Kb。通过合并CNVs,最终获得了4,927个CNVRs,其中包括3,410个大小在1Kb到1650.2Kb之间的“缺失”区域,以及1,517个大小在1.3Kb到368Kb之间的“重复”区域。群体特异性CNVRs的数量分别为185(OL)和183(PO)。在所有个体中,检测到最多的CNVRs位于OAR11,其中有294个“缺失”和188个“重复”。约3,137个“缺失”的大小在1Kb至50Kb之间,其中1,954个(62.28%)小于10Kb。共有1,377个“重复”的大小在1.3Kb和50Kb之间,735个(53.37%)小于10Kb。将所有的CNVRs与绵羊的数量性状基因位点(QTL)进行重叠分析,140个QTL与部分CNVRs重叠超过1Kb。在CNVRs重叠的基因中,鉴定出5个与藏系绵羊的消化代谢、抗病性和繁殖性能等适应性进化性状相关的重要功能基因:XIRP2、ABCB1、CA1、ASPA和EEF2。综上所述,本研究明确了盘欧羊选育群体、欧拉羊群体和盘羊群体三者的遗传关系。通过对盘欧羊选育群体和欧拉羊群体进一步开展连续纯合性分析,选择信号分析和基因组拷贝数变异分析,筛选出与高原适应性和生产性能相关的一些重要功能基因。本研究为将来藏系绵羊的育种工作提供分子标记,有助于推动藏系绵羊的遗传学研究进展,对于保护和合理利用藏系绵羊的遗传资源具有重要意义。

目的:抑郁症的发病率、复发率较高。根据抑郁障碍防治指南,患者从起病到接受系统治疗的平均时间为3年。BI 10773研究购买抑郁症的误诊和迁延病情给患者和社会造成了巨大经济Gefitinib-based PROTAC 3负担。氢质子磁共振波谱是抑郁症等疾病的重要诊断手段之一。然而既往多数研究仅采用波谱等影像指标来预测疾病诊断。抑郁症的发病机制是基于生理-心理-社会的综合模型。仅采集单维度的神经影像信息,易忽略患者重要的临床风险因子。童年创伤是抑郁症的重要风险因子之一。为了提升诊断的准确率,现将童年创伤等指标结合波谱特征,建立预测抑郁症诊androgenetic alopecia断的综合模型。方法:根据DSM-5诊断标准,共入组72例未经治疗的18-50岁抑郁症患者,招募30名不伴童年创伤的健康对照。现检测被试双侧前额叶白质、前扣带回皮质、壳核和小脑的胆碱和N-乙酰天门冬酸与肌酸的比值,联合情感虐待、情感忽视、躯体虐待、躯体忽视、性虐待以及性别、年龄、教育年限共28个特征指标,预测标签为抑郁患者或健康对照。采用可优化的最近邻(K-Nearest Neighbor,KNN)模型,对比预测变量为28个全特征和仅20个波谱特征的模型,采用十折交叉验证评估结果。结果:全特征的预测模型查准率(Precision)为98.1,召回率(recall)为87.9%,F1值为92.7%。仅采用波谱预测诊断时,查准率为81.6%,召回率为96.6%,F1值为88.2%。综合来看,全特征的F1值高出波谱特征模型约5%,这说明采用基于童年创伤、波谱特征的模型分类效果优于仅采用波谱特征的模型。结论:结合了患者童年创伤和波谱特征的模型分类准确性更好。未来临床诊断过程中,应综合患者的生理心理等多模态指标,建立抑郁症等的诊断分类模型。

柑桔衰退病毒(Citrus tristeza virus,CTV)是对柑桔产业具有毁灭性危害的病原之一。柑桔衰退病毒JY基因型(Genbank登录号为ON094625)是最近在来自湖南江永的一份道县野桔材料上获得的。为了明确JY基因型在我国的发生状况及其分子特征，对9个柑桔主产区(福建、浙江、广东、广西、湖北、重庆、四川、江西和湖南)的栽培柑NSC 127716小鼠桔以及4个地区[湖南的江永、宜章(莽山)和道县，江西的崇义]的野生柑桔进行JY基因型分子检测，并对分离物的ORF1b、p33、p25、p23基因进行分析。结果表明，仅在来自湖南江永自然生态中的道县野桔样品中检出JY基因型阳性样品(46个样品中检出12个JY基因型阳性样品),说明JY基因型在我国的发生分布并不广泛。ORF1b、p33、p25、p23基因序列多样性、遗传分化和分子变异分析表明，JY基因型12个分离物间核苷酸和氨基酸序列相似性(>96.8%)极高；JY基因型分离物与CTV其他基因型分离物存RSL3体外在明显的遗传分化，ORF1b、p33、p25、p23基因序列的平均核苷酸序列相似性分别为79.2%～92.7%、80.8%～85.9%、90.5%～93.6%、87.5%～91.8%,而平均氨基酸序列相似性分别为89.5%～98.1%、80.8%～84.4%、93.7%～97.3%、85.4%～91.6%;遗传分化系数(F_(st))均明显高于0.25;JY基因型种群与其他基因型种群的差异非常大(分子变异大于43%,p值为0.001),且基因交流小(N_m=0.396)。ORF1b、p33、p25、p23基因单独及4个基因联合的系统发育分析，表明JY基因型12个分离物均与JY-2聚集在同一簇，且独立于现有CTV其他基因型之外，进一步immune sensor证实JY基因型与CTV其他基因型分离物存在明显的遗传分化，可能为我国特有CTV基因型株系。

柱头外露作为提高作物异交率、制种纯度和降低制种成本的优良性状，在LBH589试剂杂交制种中得到了广泛的利用。绿豆是一种闭花授粉的作物，被报道的柱头外露突变体很少。通过对冀绿7号的化学诱变，发现了1个柱头外露突变体se2，为明确该突变体柱头外露的分子机制，对该突变体及其野生型冀绿7号即将开放的花蕾进IDN-6556小鼠行了转录组测序(RNA-seq)分析。根据差异倍数|log_(2 )(Fold Change) |≥1，P≤0.05的标准筛选，在se2中共得到572个差异表达基因(differentially expressapplied microbiologyed genes， DEGs)，其中262个DEGs上调，310个DEGs下调。在基因本体(gene ontology， GO)数据库中，差异表达基因显著富集到代谢和生物合成等生物过程，定位在质外体和细胞壁、细胞膜等区域，与结合、氧化还原等分子功能有关。在京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genome， KEGG)数据库中，差异表达基因显著富集在植物激素信号传导、次生代谢物生物合成等通路。功能注释发现许多有关细胞壁合成和代谢、细胞分裂和细胞扩张、植物激素相关的基因，因此推测se2突变体中龙骨瓣的细胞分裂、细胞扩张以及植物激素信号传导过程受到影响，从而导致了柱头外露。本研究为今后探究绿豆柱头外露的分子机制以及该性状在绿豆杂种优势中的利用奠定了基础。

目的 探索可在疾病早期区分双相抑郁与单相抑郁的外周血免疫炎症指标并构建预测模型，为双相抑郁与单相抑郁的早期鉴别、早期治疗提供依据。方法 选取2013年1月至2019年12月在首都医科大学附属北京安定医院住院≥2次，且首次入院时诊断为抑郁障碍的患者487例，根据此后住院记录中的诊断分为单相抑郁组357例和双相抑郁组130例。通过倾向性评分匹配法，两组各纳入102例患者。比较两组患者首次住院时的一般资料及中性粒细胞/淋巴细胞比值（NLR）、单核细胞/淋Captisol价格巴细胞比值（MLR）、血小板/淋巴细胞比值（PLR）、C反应蛋白（CRP）、补体3(C3)、补体4(C4)、免疫球蛋白A(IgA)、免疫球蛋白G(IgG)、免疫球蛋白M(IgM)。采用二项Logistic回归分析控制混杂因素，探索双相抑郁的早期预测因子。采用受试者工作特征（ROC）曲线分析免疫炎症因子对双相抑郁的早期预测价值。结果 单相抑郁组与双相抑郁组的NLR、MLR、C3、CRP比较差异有统计学意义（Z=2.004、3.062、2.333、2.233;P<0.05）。二项Logistic回归分析显示，MLR(OR=1.631,95%CI=1.206～2.194)和C3(OR=1.195,95%CI=1.033～1.383)是双相抑郁的影响因素（P<0.05）。ROC曲线分析结果显示，Logistic回归模型预测双相抑郁的AUC为0.669，敏感度为phage biocontrol78.4%，特异度为53.9%。结论 MLR及Rapamycin抑制剂C3水平升高可能是双相抑郁的早期预测指标。

目的 初步探讨不同提取工艺下红参-制何首乌药对对神经细胞的抗衰作用，为红参-制何首乌药对在抗衰及抗阿尔茨海默病（AD）作用的应用提供数据支撑。方法 分别制备30%和70%乙醇回流提取物，30%和70%乙醇渗漉提取物和水提取物。通过流式细胞术检测不同提取物对HT22细胞surrogate medical decision maker中β-半乳糖苷酶含量的影响，初步筛选红参-制何首乌药对神经细胞抗衰效果最佳的提取物，并通过β-半乳糖苷酶染色直观分析该提取物对神经细胞的抗衰效果，用秀丽隐杆线虫寿命试验及瘫痪实验验证其抗衰及抗AD作用。结果 红参-制何首乌此网站药对的不同提取方式均对HT22细胞具有显著的抗衰老作用，其中70%乙醇渗漉提取物效果最佳。对其进行多浓度验证，显示具有剂量依赖性的保护作用。浓度为0.2 mg·mL~(-1)的70%乙醇渗漉提取物对秀丽隐杆线虫的寿命有明显的延长作用，浓度为0.008mg·mL~(-1)的70%乙醇渗漉提取物具有https://www.selleck.cn/products/dinaciclib-sch727965.html缓解瘫痪的趋势。结论 红参-制何首乌药对的70%乙醇渗漉提取物具有明显抗神经细胞衰老的作用，具有抗衰老延长寿命与治疗AD的潜力，应深入研究。

DS-3201采购[目的]通过不同浓度白芨多糖干预内毒素激活后的小鼠RAW264.7巨噬细胞株，明确白芨多糖在细胞模型中对巨噬细胞TLR4信号通路中相关分子的干预作用。[方法]采用CCK-8法测定不同浓度白芨多糖溶液对Raw264.7巨噬细胞株的最大无毒浓度；采用ELISA法检测正常对照组，内毒素组，高、中、低浓度白芨多糖组，美沙拉嗪组促炎细胞因子TNF-α、IL-6、IL-1β和IL-17的表达水平；采用Real-tiimmune cell clustersme PCR法和Western blot法检测各组TLR4、MyD88、IRAK1、IKK-β、IRF3、IκB-α、NF-κB的mRNA和蛋白的表达情况。采用免疫荧光法检测各组TLR4和NF-κB的表达情况。[结果]内毒素组的各促炎细胞因子相较于正常对照组的促炎细胞因子明显升高，具有显著差异(P<0.05或0selleck激酶抑制剂.01)。而白芨多糖作用于内毒素组巨噬细胞后，其促炎细胞因子、TLR4的mRNA表达量和蛋白含量及TLR4介导的下游MyD88,IKK-β,IκB-α和NF-κB分子mRNA表达量和蛋白含量均显著下降(P<0.05或0.01)。[结论]白芨多糖可通过拮抗内毒素诱导的巨噬细胞TLR4/NF-κB通路的活化，而影响促炎细胞因子的表达。

4-羟基香豆素具有抗凝血功能Fungal biomass,用于治疗血栓栓塞性疾病,是抗凝血药物华法林的重要直接前体,也可用于抗癌、杀鼠、制作合成香料等,具有重要的应用价值。传统的化学合成法成本高、工艺复杂、需要高温高压且收率低,生物合成4-羟基香豆素及其衍生物具有重要意义。本研究利用合成生物学技术和策略,优化了生物合成4-羟基香豆素的菌株,实现了4-羟基香豆素的高产。通过大肠杆菌BW25113基因组改造(整合莽草酸上游途径关键基因aro G~(fbr)并敲除降解合成途径中间产物的硫酯酶基因ydi I)、4-羟基香豆素合成质粒模块优化、发酵培养基组分优化,实现GSI-IX了目前生物合成4-羟基香豆素的最高产量1157 mg/L。初步实现4-羟基香豆素的高产,但其较高的细胞毒性成为进一步提高4-羟基香豆素产量的瓶颈。为解决4-羟基香豆素细胞毒性高的问题,本研究通过筛选四种糖基转移酶得到Os SGT1,成功将4-羟基香豆素转化为低细胞毒性的4-Naporafenib试剂羟基香豆素苷,添加实验胞内糖基化效率为0.65%。体外纯化Os SGT1进行酶动力学分析,得知该酶对4-羟基香豆素的kcat/Km=0.45 m M~(-1)min~(-1)。分别采用添加分子伴侣、载体优化、培养基组分优化等方式,增强Os SGT1胞内糖基化效率,添加实验胞内糖基化效率接近100%。进行发酵罐培养制备糖苷产品,分别添加5 g/L、10 g/L、20 g/L不同浓度的4-羟基香豆素底物,糖基化效率随底物浓度降低,分别为96.7%、59.5%和1.37%,用发酵罐细胞液制备4-羟基香豆素苷产品,纯度可达92%。将OsSGT1引入从头合成4-羟基香豆素途径,经质粒模块优化和启动子优化,首次实现了生物合成4-羟基香豆素苷,产量达到1793 mg/L。通过酸水解和酶水解对4-羟基香豆素苷的水解进行研究:测试不同温度、乙醇浓度、酸浓度对4-羟基香豆素苷水解的影响,水解率达到32.0%;筛选大肠杆菌内源性糖苷水解酶,糖苷水解率达18.6%。