基于转录组测序的卵巢癌铁死亡差异基因筛选及生物信息学分析

目的 探究卵巢癌铁死亡关键差异基因及其潜在作用机制。方法 基于Illumina测序平台对铁死亡诱导剂大鼠肉瘤基因选择性致死化合物3(RSL3)给药后的卵巢癌OVCAR8细胞株进行转录组测序。采用DESeq2算法筛选卵巢癌铁死亡差异基因,并采用基因本体(GO)、京都基因与基因组百科全书(KEGG)、基因集富集分析(GSMK-2206EA)和蛋白互selleck作网络(PPI)分析对差异基因富集的分子功能和信号通路进行综合分析。结果 转录组测序数据质控合格,平均比对率为(0.968±0.002)%。差异分析共筛选出1 834个铁死亡差异基因,其中包括805个上调基因和1 029个下调基University Pathologies因。GO和KEGG分析显示差异基因主要富集在细胞周期相关生物学功能以及铁死亡、内质网蛋白加工、p53信号通路、丙氨酸、天冬氨酸和谷氨酸代谢等信号通路。GSEA分析显示诱导卵巢癌细胞铁死亡激活了单加氧酶活性、铁离子集合等分子功能,过氧化物生物合成、花生四烯代谢和铁离子响应等生物学过程以及干扰素α、β信号、下调顺铂耐药、铁摄取和转运等信号通路。PPI分析确定了5个铁死亡关键差异基因,包括细胞周期蛋白依赖性激酶1(CDK1)、细胞周期蛋白A2(CCNA2)、细胞周期蛋白B1(CCNB1)、polo样激酶1(PLK1)、乳腺癌1号基因(BRCA1)。结论 基于转录组测序和生物信息学分析能有效识别卵巢癌铁死亡差异基因及其信号通路,为靶向铁死亡开发新的卵巢癌治疗策略提供了潜在的药物作用靶点。

紫癜性肾炎患儿一般临床指标与肾脏病理相关性探讨

目的 分析紫癜性肾炎(HSPN)患儿一般临床指标与肾脏病理间的关系,探讨预测肾脏病理分级的临床标志物。方法 回顾性分析2017年1月—2021年12月本院收治的经肾活检确诊的69例HSPN患儿的临床和实验室资料,并根据ISKDC分级系统进行肾脏病理分级,分析不同病理分级间各临床指标是否存在差异。结果 本组资料中,过敏性紫癜(HSP)患儿肾脏受累常发生在起病后4周内。69例HSPN患儿肾脏活检病理分级示Ⅱ级30例(43.5%),Ⅲa级12例(17.4%),Ⅲb级27例(39.1%),无Ⅰ级、Ⅳ级、Ⅴ级和Ⅵ级。中性粒细胞计数/淋巴细胞计数(NLR)、血小板计数/淋巴细胞计数(PLR)、血免疫球蛋白和补体、凝血和纤溶系统相关指标等在各病理分级间无统计学差异(P>0.05),而血清白蛋白(ALB)、24小时尿蛋白(24 h-UP)、尿白蛋白(UA)Pevonedistat采购、尿IgG(U-IgG)水平在各病理分级间存在统计学差异(P<0.0此网站5);进一步两两比较,Ⅱ级与Ⅲa级、Ⅲa级与Ⅲb级间无统计学差异,仅在Ⅱ级与Ⅲb级间存在统计学差异。分析各病理分级的蛋白尿情况,显示Ⅲb级HSPN患儿多表现为肾病范围蛋白尿,且主要为肾小球源性,以UA为主要成分;immunogen designU-IgG水平亦与肾脏病理分级成正相关,考虑可能系肾损伤较重致其升高。此外,24 h-UP总水平的升高与病理分级成正相关(r=0.308,P=0.011),其预测Ⅲb级病理分级的ROC曲线下面积为0.702,当24 h-UP>24.79 mg·kg~(-1)时,预测的灵敏度和特异度分别为61.5%、81.0%。结论 HSPN患儿尿蛋白水平的高低与肾脏病理类型密切相关;尤当24 h-UP>24.79 mg·kg~(-1)时,提示肾脏病变程度较重,临床可参照此标准初步预测HSPN患儿的肾脏病理分级。

肠胃康颗粒联合含铋剂四联疗法治疗慢性胃炎合并幽门螺杆菌感染的临床研究

目的 探讨肠胃康颗粒联合含铋剂四联疗法在慢性胃炎合并幽门螺杆菌(Helicobacter pylori,Hp)感染患者中的应用效果。方法 选取厦门大学附属第一医院鼓浪屿医院2019年10月—202JAK/STAT抑制剂1年10月治疗的84例慢性胃炎患者作为研究对象,根据治疗方法的不同将84例患者分为实验组和对照组,各42例。实验组采用肠胃康颗粒联合四联疗法治疗,对照组采用含铋剂四联疗法治疗,2组均治疗14 d。对比2组治疗前、治疗14 d时的中医证候评分、炎症指标,记录2组停药1个月时的Hp感染转阴情况。结果 2组经过14 d的治疗,与治疗前对比,中医证候评分均明显降低,且实验组更低(P<0.05);实验组停药1个月时的Hp转阴率高于对照组(P<0.05);2组经过14 d的治疗,与治疗前相比,各炎症指标(C-反应蛋白、白细胞介素-6、白细胞介素-10)水平均显著降低,且实验组更Trickling biofilter低(P<0.05)。结论 肠胃康颗粒联合含铋剂四联疗法治疗可有效改更多善慢性胃炎合并Hp感染患者临床症状,减轻炎症反应,提高Hp感染转阴率。

薯蓣皂苷对缺血性脑损伤模型大鼠cAMP/PKA通路、NHE1和GLUTs蛋白的调控作用

目的 探究薯蓣皂苷对缺血性脑损伤模型大鼠环腺苷酸(cAMP)/蛋白激酶(PK)A通路、葡萄糖转运蛋白(GLUTs)、1型Na~+/H~+交换蛋白(MLN4924抑制剂NHE1)的调控作用。方法 60只SPF级雄性SD大鼠,随机分为假手术(J)组、模型(MCAO)组、尼莫地平(N)组(15 ml/kg)、薯蓣皂苷高、中、低剂量(H、M、L)组(200、100、50 mg/kg),每组10只,线栓法构建大鼠大脑中动脉缺血(MCAO)再灌注模型,造模成功后灌胃给药7 d(1次/d)。测定各组大鼠神经功能评分,Western印迹检测脑组织中GLUTs和NHE1蛋白biomimetic robotics水平,酶联免疫吸附试验(ELISA)检测脑脊液cAMP、PKA水平。结果 与J组比较,MCAD组神经功能评分显著增高,脑脊液中cAMP、PKA含量显著降低,GLUTs表达水平显著减少,NHE1表达水平显著升高(均P<0.01)。与MCAO显著组相比,H、M、L组能显著改善神经病学症状(P<0.01,P<0.05),显著升高cAMP、PKA含量及GLUTs表达水平,并显著降低NHE1表达水平(P<0.01,P<0.05),其中H组效果最佳,与N组接近。结论 薯蓣皂苷可通过上调cAMP/PKA通路,升高GLUTs、降低NHE1水平,来缓解MCAO模型大鼠脑组织缺血NSC 125973小鼠缺氧,保护脑组织。

冬虫夏草菌对低温处理的响应研究

冬虫夏草是一种虫菌复合物,具有多种药理活性。作为名贵中草药,其具有独特的生长环境及生命周期,须经过低温诱导才能形成子实体。目前,低温对冬虫夏草生长发育的影响机制尚不清楚,研究资料缺乏。本论文以祁连山东麓高山草甸冬虫夏草单子囊孢子菌株TZ8-1为研究对象,常温培养(18℃,对照温度)和低温(-2℃和4℃)培养10天、30天、50天、70天后,利用光学显微镜观察菌落和菌丝形态、菌落鲜重和干重变化,以及分生孢子的发育情况;分析关键代谢物(如尿素、甘露醇、多酚和多糖)的积累变化;RNA-seq和基因表达差异技术挖掘冬虫夏草菌在低温(-2℃)胁迫下的响应基因,初步探索冬虫夏草菌菌丝在外观形态、生理生化和基因表达水平等多方面对低温的响应特征,为低温诱导冬虫夏草子实体发育提供理论基础。主要结果如下:1、低温培养过程中冬虫夏草菌菌丝形态有明显变化:菌落表面覆有绒毛状的气生菌丝,且伴有黄色菌丝带出现,菌丝膨大、变粗、扭结程度加深,分生孢子和气生菌丝的生长受到抑制,但色素沉积无明显变化。不同低温处理的冬虫夏草菌菌丝带出现的时间不同,菌丝扭结程度也不同。2、抗逆活性物质变化:-2℃和4℃处理后甘露醇含量呈先降低(49.69±1.02 mg/g,47.28±0.69 mg/g)后上升(93.43±0.77 mg/g,83.96±0.37 mg/g)的趋势;多糖含量呈先上升(14.29±0.58 mg/g,15.34±0.33 mg/g)后下降(8.07±0.40 mg/g,6.35±0.40 mg/g)的变化趋势;多酚含量在-2BAY 73-4506浓度℃处理后呈先上升(143.02±4.18mg/g)后下降(46.2±4.31 mg/g)的趋势,而经过4℃处理后显著下降(32.43±0.39 mg/g)趋势;尿素含量呈单峰响应特征,-2℃处理50天时达到峰值(22.28±0.60 mg/g),4℃处理30天时出现峰值(19.82±0.67mg/g),而在70天时尿素含量则都显著下降(9.23±0.48 mg/g,7.81±0.15 mg/g)。3、差异表达基因:T10-vs-CK组基因表达差异最小,共筛选到1887个显著差异表达的基因,T30-vs-CK组共筛选到3053个显著差异表达的基因,T50-vs-CK组共筛选到2289个显Biogenic resource著差异表达的基因,T70-vs-CK组基因表达差异最大,共筛选到3062个显著差异表达的基因。除了T10-vs-CK组上调基因数目多于下调基因数目,其余各组都是下调基因数目多于上调基因数目。4、差异功能基因参与物质代谢:低温处理冬虫夏草菌后发现了影响甘露醇、多糖、多酚和尿素等代谢通路的关键基因。低温处理后冬虫夏草菌中甘露醇的变化可能与甘露醇-1-磷酸5-脱氢酶(EC:1.1.1.17)等基因差异表达有关,多糖的变化可能与己糖激酶(EC:2.7.1.1)等基因差异表达有关,多酚变化可能与组氨醇磷酸氨基转移酶(EC:2.6.1VX-661体内实验剂量.9)等基因相关,而尿素含量的变化可能与尿素羧化酶(EC:6.3.4.6)等基因相关。q RT-PCR结果与转录组测序结果一致。综上,通过冬虫夏草菌对低温响应结果的分析,结果显示气生菌丝减少、菌丝变粗,扭结、生物量下降;关键代谢物甘露醇累积量增多,多糖、多酚和尿素含量下降;不同处理时间下差异表达基因数目不同,主要参与了甜菜碱生物合成、核糖体、酪氨酸代谢、精氨酸和脯氨酸代谢等途径,初步揭示了冬虫夏草菌对低温生境的适应机制。

一株空肠弯曲菌噬菌体vB_Cj_QDYZ的生物学特性和全基因组分析

空肠弯曲菌是一种重要的人www.selleck.cn/products/cb-839畜共患病原菌,能引起人类细菌性腹痛腹泻。随着空肠弯曲菌耐药性日益严重,亟需筛选能高效裂解空肠substrate-mediated gene delivery弯曲菌的噬菌体,为应用噬菌体防治空肠弯曲菌污染提供理论基础。该研究分离一株能高效裂解空肠弯曲菌的噬菌体,将其命名为vB_Cj_QDYZ。电镜结果显示该噬菌体有一个正二十面体的头部(直径约100.81 nm)和一条可伸缩的尾部(长度约65.90 nm)。噬菌体vB_Cj_QDYZ的温度耐受范围为30~60℃,在pH值为3~12时效价较稳定。噬菌体的最佳感染复数为0.01,一步生长曲线表明,噬菌体的潜伏期是60 min,裂解期是150 min,爆发量是45 PFU/cell。噬菌体的基因组全长为130 627 bp, G+C含量为26%,共有165个开放阅读框,3个tRNA。基因组中不含毒力基因、抗生素耐药基因及过敏原基因。比较基因组学表明噬菌体vB_Cj_QDYZ可能是来自EucampyvirinaeSAHA价格亚科,Fletchervirus属的新成员。噬菌体vB_Cj_QDYZ是一株裂解能力较强、热稳定性和pH稳定性良好的空肠弯曲菌噬菌体,具有开发为新型空肠弯曲菌抗菌剂的潜力。

丹阳市汉族女性叶酸代谢关键酶基因多态性分布特征研究

目的 研究丹阳市汉族女性叶酸代谢关键酶MTHFR和MTRR的基因多态性分布特征。方法 选取2015—2020年在丹阳市妇幼保健院进行孕期检查的汉族健康女性6 074名,采集口腔黏膜上皮细胞,提取基因组DNA,通过荧光定量PCR检测MTHFR C677T、A1298C及MTRR A66G基因位点情况。结果 入组人群的MTRR A66G和MTHFR C677T、A1298C位点基因多态性分布均符合Hardy-Weinberg平衡分析(均P>0.05)。丹阳市汉族女性MTHFR C677T位点野生基因型CC型占比为30.3%,杂合突变型CT型占比为48.4%,纯合突变型TT型占比为21.3%;MTHFR A1298C位点AA基因型占比为68.8%,AC基因型占比为28.1%,CC基因型占比为3.1%;MTRR A66G位点AA基因型占比为56.7%,AG基因型占比为37.3%,GG基因型占比为6.0%。丹阳市汉族女性MTHFR C677T位点等位基因C、T频率分别为54.5%和45.5%,MTHFR A1298Medical Scribe位点等位基因A、C频率分别为82.9%和17.1%,Cobimetinib临床试验MTRR A66G位点等位基因A、G频率分别为75.3%和24.7%。丹阳市汉族育龄女性MTHFR A1298C和C677T位点有8种组合,频率最高的是AA/CT(33.5%),两位点间存在连锁不平衡(D’=0.992,r~2=0.17)。结论 丹阳市汉族女性叶酸CX-5461利用能力中等,高风险人群还需加强孕期管理。

黄皮新肉桂酰胺B的小鼠降脂活性及毒副作用

目的:首次探究鸡心黄皮果核的黄皮新肉桂酰胺B(Lansiumamide B, LB)作用于C57BL/6小鼠高脂肥胖模型中的降脂活性及在实验过程中的毒副作用,为其应用于更多活性领域研究提供安全性依据。方法:以C57BL/6小鼠为动物模型,经口灌胃LB以探究对小鼠的NOAEL(No Observed Adverse Effect Level),作为降脂实验的浓度设置依据;建立高脂小鼠模型后,对小鼠给药灌胃4周,通过体重、血脂生化指标、胰岛素抵抗、氧化应激等指标评价LB的降脂活性。结果:经口急性Lapatinib纯度毒性实验结果得出LB对C57BL/6小鼠的NOAEL为2 Liproxstatin-1纯度g/kg·bw (body weight);高脂模型实验结果显示LB能够显著降低小鼠体重,HLB(80 mg/kg药物组)与Hbiotic indexFD(高脂模型组)相比:体重下降15.51%,Lee’s指数下降3.25%,血清中HDL-C(High Density Lipid-Cholesterol)上升38.04%,SOD(Superoxide Dismutase)、GSH-Px(glutathione peroxidase)和CAT(Catalase)酶活提高了41.86%、41.95%和105.50%。结论:LB的NOAEL为2 g/kg·bw,在NOAEL内的浓度对小鼠具有显著降脂活性且无明显且无可见毒副作用,为开发其成为天然降脂药物提供理论依据。

雷公藤多苷联合达格列净治疗糖尿病肾病的疗效分析

目的 探讨雷公藤多苷联合达格列净治疗糖尿病肾病的临床疗效。方法 将2020年1月—2021年6月本院确诊的2型糖尿病肾病患者120例,按照随机数表法分为对照组及观察组,每组患者60例Talazoparib体内实验剂量。两组均进行常规治疗,在此基础上对照组给予达格列净治疗,观察组给予雷公藤多苷联合达格列净治疗。比较两组的临床治疗效果,包括治疗前后的肾功能指标、代谢指标,同时记录治疗过程中出现的不良反应。结果 治疗效果方面,观察组的血肌酐、24 h尿蛋白定量均较对照组下降,血白蛋白较对照组升高,肾功能指标差Genetic research异具有统计学意义(P<0.05);两组的空腹血糖、糖化血红蛋白、血尿酸水平均较治疗前明显下降,但组间无统计学差异(P>0.05)。不良反应方面,观察组和对照组治疗后低血糖、肝功损害等相关不良反应发生率分别为8.33%和6.67%,但差异无统计学意义(P>0.05)。结论 在糖尿病肾病的治疗中,雷公藤多苷联合达格列净可有效降低患者血肌酐和尿蛋白水平,升高人血白蛋白,进而改善患者的肾脏预后,同时不良反更多应无明显增加,整体临床效果较理想。

阿尔茨海默病的AAV基因治疗研究进展

阿尔茨海默病(Alzheimer′s disease, AD)是导致痴呆最主要的疾病。据估计,2020年全球AD及相关痴呆患者有约5427万,其中超过1/4患者在我国。随selleck Vorinostat着全球人口老龄化加快,AD患者数目快速增加,AD在给患者带来沉重疾病痛苦的同时,也将给家庭和社会带来沉重经济压力。当前,治疗AD的药物还只是着眼于缓解症状,并不影响疾病的进程。虽然最近临床试验数据表CL13900溶解度明,多个β-淀粉样蛋白(amyloid-beta, Aβ)抗体药物可以改善病理和减缓疾病进程,但其临床价值一直饱受争议。所以,研发出新的有效的AD治疗药物迫在眉睫。传统AD药物的研发失败率高达99.6%,使得科学家们不得不积极探寻新的AD疗法。腺相关病毒(adeno-associated virus, AAV)基因治疗是一种新兴的、强有力的治疗手段,在治疗其他神经退行性相关疾病上已取得较大成功,提示其在AD的治疗上极有可能取得突破。本研究在梳理当前国内外AD发病现状和风险因素的基础上,明确提出目前亟待新的AD治疗药物和治疗方法;通过介绍AAV基因治疗AD的优势和潜能,并基于Aβ级联反应假说、tau蛋白假说、神经营养因子假说、APOE假说、神经炎症假说,自噬-溶酶体障碍假说、线粒体功能障碍假说等各种假说机制,综述了AD的AAV基因治疗临床前和临床研究进展,并提出AAVGenetic or rare diseases基因治疗虽尚处早期阶段,其发展充满挑战,但终将可能为AD的治疗带来新希望和新突破。