大肠杆菌乳酸脱氢酶的乙酰化研究及其在代谢工程中的应用

蛋白质的赖氨酸乙酰化修饰是一种进化上保守的翻译后修饰(PTM),在细菌的多种生理和代谢过程中发挥重要作用。乙酰化nursing in the media修饰可以调控酶活,因此可以作为一种很有前途的代谢调控手段。乳酸脱氢酶(LdhA)是NADH依赖的催化丙酮酸合成乳酸的保守酶,其天然酶活经常限制乳酸合成。乳酸商业价值较高,同时也是微生物发酵的主要副产物,其合成调控是代谢工程经久不衰的课题。大肠杆菌作为代谢工程中最常见的宿主之一,被用于合成乳酸在内的大量化学品,但是目前仍不清楚其对大肠杆菌LdhA酶活的影响及调控机制。基于此,本文选取大肠杆菌LdhA为研究对象探究其乙酰化修饰机制。体内和体外两个层面确定大肠杆菌LdhA的乙酰化修饰机制,并探究乙酰化修饰对LdhA功能的影响,最后成功实现乙酰化修饰在乳酸合成调控中的应用。本研究主要结果如下:一.鉴定了大肠杆菌LdhA的乙酰化修饰机制,即LdhA通过乙酰磷酸(AcP)依赖的非酶促机制和乙酰化酶Pat介导的酶促机制乙酰化,乙酰化后的LdhA不可被去乙酰化酶CobB去乙酰化。添加不同碳源培养条件下的LdhA乙酰化程度差异显著,探究发现是由于不同碳源培养条件下导致AcP基底水平不同。不同碳源培养条件下LdhA乙酰化差异是由AcP依赖的非酶促机制调节,在此过程中Pat不发挥调控作用。二.乙酰化修饰可以调控大肠杆菌LdhA的功能。在体外条件下,利用酶催化和非酶催化机制实现人工调控LdhA的乙酰化修饰水平,将Pat、Raf抑制剂CobB和AcP分别与LdhA孵育发现乙酰化修饰降低大肠杆菌LdhA总体酶活。探究还发现乙酰化修饰降低LdhA蛋白水平。三.通过质谱鉴定到大肠杆菌LdhA的四个乙酰化修饰位点,不同位点乙酰化修饰对LdhA酶活的影响不同。结合大肠杆菌LdhA结构分析,这取决于不同赖氨酸位点特定的空间位置。通过同源建模发现,K70位于催化域的远端,该位点乙酰化后对LdhA功能影响较小。K154位于NADH结合结构域,该位点赖氨酸乙酰化使得其与NADH的结合能力下降,导致LdhA酶活下降。K9和K248都与酸性氨基酸形成盐桥,当位点的赖氨酸发生乙酰化时盐桥破坏导致LdhA酶活改变。序列比对进一步表明K248在不同的细菌物种中高度保守,这表明K248是关键氨基酸位点,因此可以作为调节细菌LdhA活性的靶点。乙酰化修饰对Lwww.selleck.cn/products/blz945dhA酶活总体影响是不同乙酰化修饰位点综合作用,解析了赖氨酸乙酰化修饰对大肠杆菌LdhA酶活的影响和调控机制。四.将LdhA的乙酰化修饰应用于乳酸合成调控。LdhA(K9R)突变体保留正电荷,避免该位点被乙醜化,且维持与酸性氨基酸的盐桥能力,最终酶活升高2.5倍,用于合成乳酸,乳酸产量提高1.74倍。LdhA(K154Q-K248Q)突变体不带电荷,模拟乙酰化的状态,酶活降低,在降低乳酸合成的同时,维持细胞正常生长。本研究首次报道了大肠杆菌LdhA的乙酰化修饰机制,探究了乙酰化修饰对LdhA功能的影响,建立了乙酰化修饰在乳酸合成调控中的应用范例。鉴于赖氨酸乙酰化修饰的高度保守性,以及LdhA在不同物种中的保守性,我们的研究可为其他物种乙酰化修饰研究和乳酸相关疾病治疗提供新的思路。

市售酱油产品生物胺含量的检测与食用安全性分析

为了揭示酱油中生物胺存在种类和水平,本研究采用丹磺酰氯柱前衍生结合高效液相色谱法对我国市售的9个品牌57种(生抽41种和老抽16种)酱油中的生物胺含量进行了分析。结果表明,酱油中苯乙胺、腐胺、组胺、酪胺是我国市售酱油中的主要生物胺成分。生抽酱油中的总胺大部分在127.86property of traditional Chinese medicine~1 273.40 mg/L,其中组胺和酪胺的含量范围分别在10.82~368.91 mg/L和0~582.77 mg/L之间。老抽酱油中总生物胺的含量分布范围为200.54~904.61 mg/L,组胺与酪胺的含量范围分别为35.07~302.35 mg/L和38.75~479.61 mg/L。风险评估分析结果表明,生抽和老抽VX-661 IC50酱油中组胺和酪胺的急性风险指数H分别为7.69%、1.99%和2.10%、0.55%,均远低于100%,且两者的慢性风险指数E值较小,范围在0.15%~1.65%之间。另外,生抽和老抽的食品安全指数(IFS)在0.001~0.016之间,远低于1。本研究表明由食用酱油中引入的组PCI-32765供应商胺和酪胺对人体健康无明显的负面危害,我国市售酱油食用安全性相对较高。

低分子肝素对复发性流产患者保胎率及血液流变学指标的影响

目的 探讨低分子肝素对复发性流产(RSA)患者保胎率及血液流变学指标的影响。方法 选取2019年6月至2022年6月滨州市中心医院生殖医学科收治的110例RSA患者作为研究对象,根据随机数字表法将其分为对照组(55例)与研究组(55例)。对照组给Panobinostat细胞培养予常规保胎治疗,研究组给予低分子肝素治疗。比较两组患者的保胎率、血液流变学指标及凝血功能。结果 研究组患者的保胎率高于对照组,差异有统计学意义(P<0.05);两组患者治疗后的全血表观黏度、全IACS-10759使用方法血还原黏度、血浆黏度均低于本组治疗前,且研究组患者治疗后的全血表观黏度、全血还原黏度、血浆黏度均低于对照组,差异有统计学意义(P<0.05);两组患者治疗后的凝血酶Optical immunosensor原时间(PT)、凝血酶时间(TT)、活化部分凝血活酶时间(APTT)均长于本组治疗前,且研究组患者治疗后的PT、TT、APTT长于对照组,差异有统计学意义(P<0.05)。结论 低分子肝素应用于RSA患者治疗中,能够提高保胎率,促进血液流变学指标及凝血功能改善。

应用No-touch技术分离静脉减轻动静脉内瘘手术后早期近吻合口静脉缺氧及内膜增生的机制及研究进展

自体动静脉内瘘(autologous arteriovenous fistula,AVF)构建selleck激酶抑制剂过程中近吻合口静脉分离所造成的滋养血管(vasa Biomass fuelvasorum,VV)损伤及AVF手术后的血流动力学改变均可导致手术后早期近吻合口静脉缺氧,激活低氧诱导因子(hypoxia inducible factors,HIFs)以调节其下游信selleckchem号通路促进血管壁的细胞增殖和胶原沉积,导致近吻合口静脉内膜增生(intimal hyperplasia,IH)与狭窄。冠状动脉旁路手术时,用于大隐静脉分离的No-touch技术(no-touch technique,NTT)能够减轻静脉分离过程中所造成的静脉VV损伤,且保留的静脉周围组织具有外支撑作用,能够减轻手术后移植静脉的血流动力学改变,从而减轻近移植静脉的缺氧及IH。近年来,该技术亦开始应用于AVF构建过程中的静脉分离,并取得了良好的临床效果。本文将对应用该技术分离静脉构建AVF减轻手术后近吻合口静脉缺氧及IH的机制及研究进展进行综述。

FOXK1调控胃癌细胞铁死亡的机制研究

目的:我国是胃癌高发区,发病率和死亡率均居所有恶性肿瘤前列,因胃癌早期症状轻微不易发现,多数患者在确诊时已属晚期,丧失了最有效的手术治疗机会。近年来,随着免疫治疗的出现及应用,胃癌患者总生存期得到了有效改善,但无论是免疫治疗还是传统化疗及靶向治疗,治疗耐药问题依然存contrast media在。迫切需要探索新的分子标志物以及探索更佳的治疗手段以减少耐药的发生,实现治疗效果最大化。铁死亡作为一种铁依赖性的非凋亡形式细胞死亡,可通过诱导其发生从而对传统疗法产生抵抗的恶性肿瘤起到抑制作用,有效延长患者总生存期。叉头框K1(FOXK1)作为叉头框(FOX)家族的一份子,可调控多种肿瘤的发生发展。研究发现,FOXK1可通过抑制胃癌细胞自噬,促进胃癌上皮间质转化,进而促进胃癌转移。而FOXK1能否调控胃癌细胞铁死亡及具体作用机制,目前尚不清楚。通过对FOXK1对胃癌细胞铁死亡的影响及可能的作用机制进行深入研究,将为寻找胃癌治疗新对策,延长患者总生存提供新途径。方法:利用GEPIA在线数据库分析FOXK1在胃癌及正常组织中的m RNA表达情况,采用免疫组化分析方法,在经青岛大学附属医院病理确诊为胃腺癌的手术标本中进行蛋白表达验证。设计相关小干扰RNA、质粒,转染胃癌细胞,构建FOXK1敲低和过表达的胃癌细胞株,采用蛋白免疫印迹和实时定量PCR方法检测FOXK1在胃癌细胞中蛋白及m RNA表达水平,观察细胞转染效率。Erastin处理建立胃癌铁死亡细胞株。CCK8,谷胱甘肽(GSH)、MDA、脂质过氧化水平检测以及透射电镜分析FOXK1对胃癌细胞铁死亡的影响。蛋白免疫印迹进一步分析FOXK1对胃癌细胞铁死亡影响中所涉及的下游调控信号通路,JASPAR在线网站预测FOXK1上游调控分子。免疫组化分析ATF3蛋白在胃癌及癌旁组织中的表达,蛋白免疫印迹检测ATF3蛋白在胃癌及正常人胃黏膜上皮细胞中的表达。质粒构建ATF3过表达胃癌细胞株,q RTselleck产品-PCR和蛋白免疫印迹分析ATF3对FOXK1 m RNA及蛋白表达的影响。结果:我们发现FOXK1在胃癌组织和细胞中相对高表达,敲低FOXK1可提高Erastin诱导的胃癌细胞铁死亡水平,过表达FOXK1通过激活PI3K/AKT/m TOR信号通路,对Erastin诱导的胃癌细胞铁死亡起抑制作用。此外,我们还发现活化寻找更多转录因子3(ATF3)在胃癌组织和细胞中相对低表达,过表达ATF3抑制了胃癌细胞中FOXK1的表达,进一步抑制PI3K/AKT/m TOR信号通路的激活促进胃癌细胞铁死亡的发生。结论:我们的研究表明FOXK1在胃癌细胞铁死亡中起着一定的影响,胃癌细胞中高表达的FOXK1可在ATF3的调节下,通过PI3K/AKT/m TOR信号通路抑制细胞铁死亡的发生,这进一步丰富了胃癌的发病机制,为胃癌靶向治疗提供了新思路。

基于FAERS数据库的塞利尼索不良事件信号挖掘与分析

目的 基于美国食品药品监督管理局(FDA)药品不良事件报告系统(FAERS)数据库,挖掘和分析塞利尼索药物不良事件(ADE)信号,为临床安全用药提www.selleck.cn/products/Vorinostat-saha供参考。方法 采用报告比值比法(ROR)和比例报告比值法(PRR)挖掘2019年3季度—2023年3季度期间塞利尼索ADE报告,利用监管活动医学词典(MedDRA)的首选系统器官分类(SOC)和首选术语(PT)对挖掘的信号进行分类和统计分析。结果 共检索到以塞利尼索为首要怀疑药物的ADE报告4 991例,涉及19868个PT。经过计算筛选后得到塞利尼索ADE信号118个,涉及16个SOC。塞利尼索ADE信号与已知的相关安全性信息基本一致,ADE主要集中在胃肠系统疾病、全身性疾病及给药部位各种反应、各类检查、代谢及营养类疾病。另外还检出药品说明书未收录的ADE信号53个,如便秘、跌倒、嗜睡和肾功能异常等。结论 基于FAERS的大数据可全面深入分析药品上市后的ADE,提Microbiology抑制剂示临床在治疗初期应密切关注塞利尼索胃肠道毒性、血液学毒性以Programmed ribosomal frameshifting及说明书未提及的风险,并采取预防措施,从而保障临床用药安全。

基于转录组测序的金钱蒲类黄酮生物合成基因的表达分析

【目的】高通量测序获取金钱蒲(Acorus gramineus)7个不同组织转录组信息,为不同组织中类黄酮化学成分合成差异提供分子信息,进而在分子水平上研究金钱蒲不同组织内类黄酮化学成分合成差异。【方法】利用高通量测序技术平台完成金钱蒲7个不同部位的转录组测序,对unigenes进行功能注释,借助注释结果挖掘类黄酮生物合成通路,筛选通路中的差异表达基因(Differentially expressed genes,DEGs)并进行表达量分析。【结果】共获得高质量数据39.91~42.RSL3化学结构97 M,总碱基量为5.98~6.45 Gb,Q30碱基百分比大于94.05%,GC含量为47.81%~50.32%。18 616条unigenGDC-0068采购es在GO数据库中获得62 506个注释,根据功能划分为细胞组分、分子功能及生物过程三大类,分别对应6、14、21个亚类,大量基因分布在细胞解剖实体、连接、催化活性和细胞过程等亚类中。10 124条unigenes富集在KEGG数据库的5大类19个亚类中,从其中筛选出4条类黄酮生物合成途径,14个关键酶,63个差异表达酶基因。这些基因在金钱蒲7个组织中具有表达差异性,表明这些结构基因在类黄酮生物合成过程中于不同部位发挥作用。【结论】研究结果丰富了金钱蒲的遗传信息,也为进一步解析金钱蒲类黄酮生物合成基因功能Bioactivity of flavonoids提供参考依据。

基于转录组测序的红树秋茄叶片发育中差异表达基因分析

为探索秋茄(Kandelia obovata)叶片发育过程中物质合成和基因表达情况,本研究对红树叶片三个发育时期的m RNA进行提取和高通量测PLX3397抑制剂序,获得高质量序列(Clean reads) 64 189 053个,高质量碱基19.29 Gb,共组装获得转录本108 077个,转录本长度大于2 000 bp的为37 206个selleck合成,200~300 bp的转录本11 797个, Q30均在95.00%左右。通过对红树秋茄叶片三个不同时期(初期,中期,成熟期)的差异基因进行KEGG富集分析,结果发现,差异基因主要富集在以下代谢途径:碳水化合物代谢途径(淀粉和蔗糖代谢),苯丙氨酸代谢,能量代谢途径,植物激素信号调控,生物碱合成,脂质代谢途径,昼夜节律信号转导途径。GO富集分析表明,差异基因主要富集在生物学过程(包括转录调控, DNA复制,蛋白磷酸化等),细胞组分(包括细胞核,细胞膜,叶绿体,线粒体等),分子功能(包括DNA结合,蛋白结合等),另外在秋茄叶片发育的三个时期共统计到22 333个SSR位Quality in pathology laboratories点,占比最高的为单核苷酸,数量为12 268条,其次为三核苷酸和二核苷酸,分别6 410条和3 245条,这些结果为红树秋茄分子标记辅助育种提供了重要依据,由于秋茄是非泌盐性红树品种,通过对成熟红树叶片进行扫描电镜的观察,发现红树叶片上表面无气孔结构,下表面分布有大量气孔,同时对叶片表面进行了元素种类和含量的分析,发现红树叶片下表面的钠离子和硫离子含量比叶片上表面高,同时在靠近叶片下表面的细胞中,发现了可能储存盐分的结构,这些结果为研究非泌盐性红树的叶片的生长发育提供了一定的理论基础。

我院2022年临床检验危急值分析

目的 对该院临床检验危急值进行分析总结,为今后危急值的持续改进提供依据。方法 回顾性分析该院2022年1月1日至12月31日检验科危急值的发生率、科室分布、项目分布和重点科室危急值单项占比情况等。结果 2022年检验科检测标本总数2 834 045份,上报危急值12 533份,危急值发生率为0.4%;危急值上报率为100%(12 533/12 533),上报及时率为98.5%(12 349/12 533)。危急值发生较多的科室为血液内科、重症医学科、急诊内科门诊、消化内二科和心血管内科门诊,占比分别为16.3%(2 046/12 533)、11.9%(1 489/12 533),7.5%(934/12 533)、4.2%(531/12 533)、3.7%(464/12 533)。危急值排名前三的项目为血红蛋白、血小板计数、血清K+,占比分别为21.5%(2 694/12 533)、14.5%Protein Conjugation and Labeling(1 816/12 533)、10.9%(1 360/12 533)。危急值发生率较高的重点科室分布情况如下:血液内科前三位项目为血红蛋白、血小板计数和白细胞计数,占比分别为43.3%(886/2 046)、34.0%(34.0/2 046)、14.0%(286/2 046);重症医学科前三位项目为FG-4592浓度活化部分凝血活酶时间、纤维蛋白原和国际标准化比值,占比分别为15.8%(235/1 489)、15.4%(229/1 489)、12.4%(184/1 489);急诊内科门诊前三位项目为血清K~+、血红蛋白和血清Na~+,占比分别为18.6%(174/934)、16.5%(154/934)、15.6%(146/934)。结论 在日常工作中,需定期对检验科的危急值进行总结分析,关注重点科室和重点项目的危急值上报工作,不断修订和完善各临床科室的危更多急值项目和警戒值,做到持续改进,提高检验科与临床科室的工作效率,更好地为患者服务。

TPHP对HEK293细胞的毒性作用及其机制研究

目的研究TPHP对HEK293细胞的毒性作用,探讨TPHP潜在肾毒性的机制,为TPHP的毒作用机理提供理论依据。方法 1)TPHP以0.0001~1000μmol·L~(-1)TPHP染毒HEK293细胞12 h、24 h、48 h、72 h后,用CCK-8方法检测细胞活力。2)以0、1、10、100μmol·L~(-1)TPHP染毒HEK293细胞24 h后,用流式细胞仪检测凋亡水平。3)以0、1、10、100μmol·L~(-1)TPHP染毒HEK293细胞24 h后,Western Blot检测细胞铁死亡、自噬、凋亡相关关键蛋白。4)以0、1、10、100μmol·L~(-1)TPHP染毒HEK293细胞24 h后,检测丙二醛(MDA)水平,研究TPHP对HEK293细胞氧化应激的影响。5)TPHP染毒HEK293细胞后进行mRNA poly转录组测序。结果 1)CCK-8结果显示,与PS-341对照组相比,各组的细胞活力呈剂量依赖性受到抑制(P<0.05)。2)流式细胞术检测细胞凋亡结果显示,与对照组相比,1、10、100μmol·L~(-1)TPHP处理组总凋亡率和晚期凋亡率无显著性差异(P>0.05);与对照组相selleckchem比,10μmol·L~(-1)TPHP处理组的早期凋亡率显著受到抑制(P<0.05)。3)Western Blot检测分析结果表明,与对照组相比,100μmol·L~(-1)TPHP处理组GPX4、Bax蛋白水平显著下降(P<0.05);LC3Ⅱ/Ⅰ、p62蛋白水平显著增加(P<0.05)。提示TPHP可能促进HEK293细胞发生自噬、铁死亡,可能抑制凋亡的发生。4)氧化应激实验结果表明,与对照组相比,100μmol·L~(-1)TPHP处理组MDA水平显著升高(P<0.05)。5)转录组测序结果显示,与对照组相比,100μmol·L~(-1)TPHP处理组的差异表达基因共1304个,其中上调基因707个,下调基因597个,KEGG通路富集分析主要涉及的关键通路包括MAPK信号通路,PI3K-Akt信号通路等。结论 TSulfonamide antibioticPHP暴露会产生肾毒性,并且可能通过MAPK、PI3K-Akt通路促进人胚肾细胞HEK293发生自噬。