HER2阳性乳腺癌铁死亡相关基因分析及预后预测模型的建立

目的 筛选影响人表皮生长因子受体2(HER2)阳性乳腺癌预后的铁死selleck亡相关基因,并构建预测模型。方法 从癌症基因组图谱数据库收集乳腺癌患者肿瘤组织RNA-seq数据和临床资料,其中HER2阳性乳腺癌185例,HER2阴性乳腺癌769例。根据HER2阳性和HER2阴性乳腺癌铁死亡相关基因表达差异确定候选基因。比较不同铁死亡相关基因表达水平HER2阳性乳腺癌的生存差异。应用Pearson相关性分析铁死亡相关基因的免疫相关性。通过CDinaciclib核磁ox和LASSO回归分析,根据中位风险评分将HER2阳性乳腺癌患者分为高风险组和低风险组,建立预后预测模型,并检验预测效能。结果 铁死亡基因FANCD2、TFRC、ATP5MC3、CS和NFE2L2不同表达水平HER2阳性乳腺癌患者生存率比较差异有统计学意义(P<0.05),其基因表达水平越高患者预后越差。上述5个铁死亡相关基因与免疫细胞存在相关性,Custom Antibody Services其中CS与CD4+T细胞存在最明显正相关,CS与NK细胞和NFE2L2与无特征细胞存在最明显负相关(P<0.01)。HER2阳性乳腺癌高风险组的生存率明显低于低风险组(P<0.05)。预后预测模型对HER2阳性乳腺癌患者治疗后3、5、8年预后预测的曲线下面积分别为0.776、0.844、0.853。结论 铁死亡相关基因FANCD2、TFRC、ATP5MC3、CS和NFE2L2与HER2阳性乳腺癌患者预后具有相关性,并且建立了预后预测模型,可有效预测HER2阳性乳腺癌患者的预后。